Podpůrný a garanční rolnický a lesnický fond, a.s. (PGRLF) respektuje rozhodnutí Evropské komise ze dne 29. července 2025, kterým byla Česká republika vyzvána zajistit vrácení podpory, jež byla podle názoru Komise vyplacena v rozporu s pravidly. Přestože PGRLF s konečným rozhodnutím nesouhlasí, je jím vázán a postupuje v plném souladu s jeho závěry.
Evropská komise v rozhodnutí uvedla, že dvouleté přechodné období podle definice malého a středního podniku (MSP) se v případě fúzí a akvizic neuplatní. Tento výklad se odchyluje od aplikační praxe PGRLF platné do 31. 7. 2018, která vycházela ze závazných předpisů EU k definici MSP (zejména z čl. 4 odst. 2 Přílohy I nařízení Komise (EU) č. 702/2014, založeném na Doporučení Komise 2003/361/ES). Podle těchto předpisů se přechodné období uplatňuje bez ohledu na to, zda ke změně velikosti podniku došlo v důsledku ekonomického růstu, fúze nebo akvizice, přičemž nařízení žádnou výjimku nestanoví. Příjemci podpory v uvedeném období postupovali při kvalifikaci podniku dle výše uvedené aplikační praxe PGRLF. Od 1. 8. 2018 PGRLF s cílem posílit právní jistotu příjemců změnil svou aplikační praxi s ohledem na nezávazný výklad uvedený v Uživatelské příručce Evropské komise, podle něhož se dvouleté přechodné období při fúzích a akvizicích neuplatní. Závaznost tohoto výkladu následně výslovně zakotvil do svých programů.
V roce 2021 zahájila Evropská komise šetření postupu PGRLF při kategorizaci podniků v případě fúzí a akvizic. PGRLF v průběhu šetření opakovaně a detailně vysvětlil, že jeho postup byl v souladu se závaznými předpisy EU. Rozhodnutím ze dne 29. 7. 2025 však Komise uzavřela, že se dvouleté přechodné období v těchto případech neuplatní, což se týká podpor poskytnutých před 1. 8. 2018. Přestože PGRLF s tímto výkladem nesouhlasí, rozhodnutí Evropské komise musí respektovat a postupuje v jeho souladu.
